分子模拟，hyperchem分子模拟主要是模拟电子性质吗

本文目录一览

1，hyperchem分子模拟主要是模拟电子性质吗
2，分子模拟里面一共有哪些相互作用力势
3，分子动力学模拟中梯度是什么东东有什么含义
4，大家化学常用分子模拟软件有哪些
5，分子模式模拟什么结构
6，分子动力学模拟的基本要点有哪些

1，hyperchem分子模拟主要是模拟电子性质吗

可以模拟电子能态和分子能量及电荷分布～力学性质模拟～

我也不确定，还是看看专业人士怎么说。

hyperchem分子模拟主要是模拟电子性质吗

2，分子模拟里面一共有哪些相互作用力势

冰密度于水冰间距要于水吧另冰晶体液体能同温度相同水释放能量才冰自内能高于同温度冰

不明白啊 = =！

分子模拟里面一共有哪些相互作用力势

3，分子动力学模拟中梯度是什么东东有什么含义

能量的梯度的负数就是受力，该粒子因为该能量项所受到的作用力。一般而言，体系有多种能量项，非成键作用如范德华作用和静电作用，成键作用如2个原子的伸缩，3个原子的键角弯曲和4个原子的二面角变化（有时还考虑还有4个原子同面的作用）。你将这所有和该粒子有关的各能量项求梯度，就可以得到该项作用相应的作用力，再对所有的力进行求和则是该粒子收到的总作用力。有了作用力，a=F/m，有加速度就可以求下一步的速度，再是下一步得到位置，有了新的位置就可以求新的势能再是受力...迭代下去，这就是分子模拟的基本流程。LZ可以去分子动力学模拟吧讨论讨论分子模拟的东西！

分子动力学模拟中梯度是什么东东有什么含义

4，大家化学常用分子模拟软件有哪些

有Amber，Gromacs和Namd，第一种要收费，推荐第三种，功能强大

不是orange吧……我觉得应该是origin. 另外一个是chembiooffice,常用的是里面的chembiodraw. 两个软件的侧重点不一样。origin主要用于科学绘图、数据分析。它支持各种各样的2d/3d图形。其中的数据分析功能包括统计，信号处理，曲线拟合以及峰值分析。而chembiooffice主要用于机构分析，可以方便地画出结构式，并计算出其理论上的核磁谱图，红外谱图等等。还可以画出化学方程式。这两个软件都是常用并且互补着用的。按照你说的用途，我感觉chembiooffice更适合一些。

5，分子模式模拟什么结构

分子模拟是分为很多类的是指构建一个模型通常是数学模型(对一种体系或过程的简化或理想化表达)以利于计算或预测，然后模仿出分子或分子体系的行为。涵盖很多很多量子力学（QM）、线性标度量子力学(Linear Scaling QM)、分子力学(MM)、分子动力学(MD)、蒙特卡洛(MC)、介观动力学(MesoDyn)和耗散粒子动力学（DPD）、统计方法QSAR(Quantitative Structure - Activity Relationship )等多种先进算法不同的方法对应不同的结构但是结构主要取决于你模拟体系的尺度比如你研究的是一个小模型那么你的模型可能包含电子这样也就更精确如果你研究的体系很庞大那么电子可能用伯恩奥本海伯恩奥本海默方程近似默方程近似所以方法和你的问题决定结构

模式识别受体（prr）识别结合的配体分子,主要是指病原微生物表面某些共有的高度保守的分子结构,也包括宿主凋亡细胞表面某些共有分子结构,可悲非特异性,免疫细胞识别.

模拟。。。其实我也想问模拟什么结构啦！急急急！！！

6，分子动力学模拟的基本要点有哪些

分子动力学模拟是从经典力学出发，把系统看成为微观粒子的集合，通过研究微观状态下的粒子在不同系综的运动方程，计算体系的构型积分，并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量，从而得到体系的宏观特征和基本运动规律。由于分子动力学模拟是基于原子间相互作用势，因此它运用非常灵活，可以应用在多种不同体系中。分子动力学模拟普遍采用的相互作用势为二体对势：Buckingham 势和 Lennard-Jones势

分子动力学是一门结合物理，数学和化学的综合技术。确定起始构型进行分子动力学模拟的第一步是确定起始构型，一个能量较低的起始构型是进行分子模拟的基础，一般分子的起始构型主要来自实验数据或量子化学计算。在确定起始构型之后要赋予构成分子的各个原子速度，这一速度是根据波尔兹曼分布随机生成的，由于速度的分布符合波尔兹曼统计，因此在这个阶段，体系的温度是恒定的。另外，在随机生成各个原子的运动速度之后须进行调整，使得体系总体在各个方向上的动量之和为零，即保证体系没有平动位移。进入平衡相由上一步确定的分子组建平衡相，在构建平衡相的时候会对构型、温度等参数加以监控。进入生产相进入生产相之后体系中的分子和分子中的原子开始根据初始速度运动，可以想象其间会发生吸引、排斥乃至碰撞，这时就根据牛顿力学和预先给定的粒子间相互作用势来对各个粒子的运动轨迹进行计算，在这个过程中，体系总能量不变，但分子内部势能和动能不断相互转化，从而体系的温度也不断变化，在整个过程中，体系会遍历势能面上的各个点，计算的样本正是在这个过程中抽取的。 + 计算结果用抽样所得体系的各个状态计算当时体系的势能，进而计算构型积分。

不知你说的是分子动力学的理论还是具体操作？这个都难一下子说清楚。如果是理论，你可以去参考一些书，其基本思想是根据牛顿力学和统计力学为基础，然后在初始条件下去模拟跟踪下一步的相互作用规律；如果是操作，那么会有不同的操作软件和技巧，这个需要在实践中慢慢学习。中文参考书你可以参考：马文淦《计算物理学》